Phenotype service

  • Adult Mouse Phenotype Pipeline · Primary mouse Phenotype
  • Metabolic and Exercise Phenotyping · Browning Challenge

    Browning Challenge

    Browning

    Browning introduce
    분석개요 Brown adipose tissue (BAT) 활성화나 White adipose tissue내의 Beige fat 유도를 위해 Cold challenge 또는
    β-adrenergic receptor agonist를 처리함
    측정 파라미터 UCP1 expression
    장비 Cold Chamber (대한바이오링크, 주문 제작)
    분석기간 3일
    구역 CV (conventional area)
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    · Metabolic Phenotype

    metabolic phenotype

    Body composition

    Body composition introduce
    분석개요 비만 및 대사질환 관련 질병연구에서 마취 없이 마우스의 생체 내 체구성 성분을 측정함
    측정 파라미터 Fat mass (g), lean mass (g), body fluid (g)
    장비 Minispec LF50 (Bruker, German)
    분석기간 1일
    구역 CV (conventional area)
    참고문헌 Shin et al. 2015, PLoS One
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    Calorimetry

    Calorimetry introduce
    분석개요 Home cage와 환경이 비슷한 조건 내에서 대사, 행동 등을 평가하는 방법으로 산소 소비 및 이산화탄소 생산량을 측정하여 Respiratory exchange ratio(RER), Heat production을 계산하고 Food, Drink 섭취량이나 Activity 혹은 Rearing를 통해 circadian pattern이나 신경행동학적 표현형을 분석할 수 있음.
    측정 파라미터 VO2, VCO2, RER(respiratory exchange rate), HEAT, ACTVITY, DRINK, FEED
    장비 Phenomaster(TSE system, German), 12 cage
    분석기간 1주
    구역 CV (conventional area)
    참고문헌 Shin et al. 2015, PLoS One
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    Histology

    Histology introduce
    분석개요 대사질환 관련 조직(fat, liver, muscle 등)의 H&E, special staining 수행
    측정 파라미터 H&E, Oil red O, immunohistochemistry(IHC)
    장비 Pannoramic SCAN (3D Histech, Hungary)
    분석기간 1주
    구역 CV (conventional area)
    참고문헌 Shin et al. 2015, PLoS One
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    · Diet Challenge & Phenotype

    diet challenge & phenotype

    Diet challenge

    Diet challenge introduce
    분석개요 식이조건에 따른 체중 변화 및 비만이 생기는지를 확인하기 위해 60% high fat diet( Research diet, D12492 )를
    생후 6주령부터 18주령까지 12주 동안 먹임
    측정 파라미터 Body weight (g)
    장비 -
    분석기간 12주
    구역 CV (conventional area)
    참고문헌 Shin et al. 2015, PLoS One
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    · Exercise Challenge & Phenotype

    exercise challenge & phenotype

    Aerobic exercise

    Aerobic exercise introduce
    분석개요 유산소 운동 효과를 확인하기 위해 동물 모델에 적용한 운동법으로 마우스용 Treadmill을 사용하여 8주간 진행
    측정 파라미터 body weight (g), total distance(m)
    장비 mouse용 트레드밀 (Exer 3/6 treadmill, Columbus Instruments, Ohio)
    분석기간 8주
    구역 CV (conventional area)
    참고문헌 Oh et al. 2013, J Int Soc Sports Nutr.
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    Resistance exercise

    Resistance exercise introduce
    분석개요 점진적 저항성 운동 방법을 동물 모델에 적용한 것으로 무게 추를 달고 사다리 오르기를 실시하여 자신이 지닌
    body weight보다 많은 부하를 주어 운동 효과가 나타날 수 있게 함
    측정 파라미터 body weight (g), weight load(% of body weight)
    장비 Customized Ladder (mice / rats)
    분석기간 8주
    구역 CV (conventional area)
    참고문헌 Son et al. 2015 Muscle Nerve
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    Treadmill exhaustion test

    Treadmill exhaustion test introduce
    분석개요 점진적 저항성 운동 방법을 동물 모델에 적용한 것으로 무게 추를 달고 사다리 오르기를 실시하여 자신이 지닌
    body weight보다 많은 부하를 주어 운동 효과가 나타날 수 있게 함
    측정 파라미터 body weight (g), weight load(% of body weight)
    장비 Customized Ladder (mice / rats)
    분석기간 8주
    구역 CV (conventional area)
    참고문헌 Son et al. 2015 Muscle Nerve
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    Grip strength

    Grip strength introduce
    분석개요 동물의 근력을 측정하는 방법으로 fore-limb/four-limb을 목적에 맞게 측정 가능
    측정 파라미터 Grip strength (g/g)
    장비 Grip strength meter (Bioseb, France)
    분석기간 1일
    구역 CV (conventional area)
    참고문헌 Son et al. 2015 Muscle Nerve
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    Hanging test

    Hanging test introduce
    분석개요 마우스의 근지구력을 평가하기 위한 방법 중 하나로써 Body weight 50% 무게의 추를 꼬리에 달아 마우스가
    grid를 놓칠 때까지의 시간을 측정하여 마우스의 근지구력 능력을 평가함
    측정 파라미터 Hanging time (s)
    장비 -
    분석기간 1일
    구역 CV (conventional area)
    참고문헌 Kim et al. 2015, Exp Gerontol
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  • Sensory Phenotyping (vision, hearing and olfaction) · Vision Phenotype

    Vision Phenotype

    Eye morphology

    Eye morphology introduce
    분석개요 마우스 외안부 질환 유무 검사
    측정 파라미터 Outer eye morphology
    장비 Micron IV basic unit (Phoenix Research Labs. USA)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 동물실험실
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    Fundus biomicroscopy

    Fundus biomicroscopy introduce
    분석개요 망막 표현형 분석 (망막 및 시신경의 형태, 망막혈관의 분포)
    측정 파라미터 Fundus biomicroscopy
    장비 Micron IV fundus imaging unit (Phoenix Research Labs. USA)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 동물실험실
    참고문헌 Chen et al., 2013. PLOS One
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    OCT

    OCT introduce
    분석개요 각막, 수정체, 망막의 단층표현형 분석
    측정 파라미터 Optical coherence tomography (OCT)
    장비 Micron IV OCT unit (Phoenix Research Labs. USA)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 동물실험실
    참고문헌 Hu et al., 2013. PNAS
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    ERG

    ERG introduce
    분석개요 시각세포 표현형 분석. 여러 단계의 빛 자극에 반응하여 생성되는 파형 (A, B 파형) 및 반응 시간 분석
    측정 파라미터 Electroretinography (ERG)
    장비 Micron IV ERG unit (Phoenix Research Labs. USA)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 동물실험실
    참고문헌 Yin et al., 2013. J Neurophysiology
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    Optomotry

    Optomotry introduce
    분석개요 마우스 시력 측정 검사. Spatial frequency level에 따른 마우스의 행동반응을 측정
    측정 파라미터 Optomotry
    장비 Optomotry (Cerebralmechanics. USA)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 동물실험실
    참고문헌 Altimus et al., 2010, Nat. Neurosci
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    · Olfactory Phenotype

    olfactory phenotype

    Olfactory behavior test

    Olfactory behavior test introduce
    분석개요 후각 자극을 통한 마우스의 행동 검사. 마우스가 싫어하는 odorant를 이용한 avoidance test, 선호하는
    odorant를 이용한 preference test
    측정 파라미터 Odorant behavior test
    장비 Smart3.0 & maze (Panlab Harvard Apparatus. USA)
    분석기간 2일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) SPF
    참고문헌 Kobayakawa et al., 2007. Nature
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    fMRI

    fMRI introduce
    분석개요 MnCl2를 마우스에 주입하여 olfactory bulb의 기능적 활성 정도를 fMRI로 촬영. olfactory brain cortex부위의
    활성을 확인하여 후각기능에 대한 영상학적 분석
    측정 파라미터 Olfactory image
    장비 Manganese-enhanced MRI (Bruker, German)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) SPF
    참고문헌 Lee et al., 2002. Magn. Reson. Med.
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    EOG

    EOG introduce
    분석개요 mouse olfactory epithelium (MOE:후각상피세포)이 냄새 자극을 받을 때 발생하는 후각 전위를 분석 하여
    후각 신경기능을 검사
    측정 파라미터 Electro-olfactogram (EOG)
    장비 EOG, 연구자 제작
    분석기간 1일
    구역 한양대 공동 연구
    참고문헌 Cygnar et al., 2010. J. Vis. Exp
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    Histopathology

    Histopathology introduce
    분석개요 후각 신경구 및 후각상피세포의 조직학적 분석 Immunofluorescence, SEM, TEM, H&E staining
    측정 파라미터 Histopathology
    장비 Hitachi SEM/TEM (Hitachi, Japan)
    분석기간 4일
    구역 연세의료원
    참고문헌 McIntyre et al., 2012. Nat. medicine
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    · Auditory Phenotype - Hearing phenotype

    auditory phenotype-Hearing phenotype

    ABR

    ABR test introduce
    분석개요 음자극에 의해 생기는 청각 전도로부터 유도되는 달팽이관(cochlea)- 뇌간(brain stem)의 반응 분석을 통해 청력
    역치 분석
    측정 파라미터 Auditory brainstem response (ABR, 청성뇌간반응)
    장비 Smart EP (Intelligent Hearing Systems, USA)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) SPF
    참고문헌 Kim et al., 2016, Antioxid Redox Signal
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    PPI

    PPI introduce
    분석개요 강도가 다른 소리 자극에 의해 유도된 놀람 반응에 대한 근전도 측정을 통해 선행자극 억제를 확인
    측정 파라미터 Pre-pulse inhibition (PPI, 선행자극 억제)
    장비 Startle response (TSE System, Germany)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) SPF
    참고문헌 Sakry et al., 2014, PLoS Biol
    제공 데이터 하단 데이터 참조

    DPOAE

    DPOAE introduce
    분석개요 외유모세포(outer hair cell)의 능동적인 미세진동에 의해 발생하는 이음향방사 분석을 통해 외유모세포의
    기능여부 확인
    측정 파라미터 Distortion prodct otoacoustic emissions (DPOAE, 변조이음향방사)
    장비 Smart EP (Intelligent Hearing Systems, USA)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) SPF
    참고문헌 Park et al., 2011, Neurosci Res
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    - Ear morphology & histopathology

    auditory phenotype-Ear morphology & histopathology

    Paint-fill injection

    Paint-fill injection introduce
    분석개요 흰색 수정액 (white-out)을 내이에 주입하여 내이의 전체 구조 분석.
    측정 파라미터 Paint-fill injection (inner ear morphology)
    장비 연구자 자체 제작
    분석기간 2일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 실험실
    참고문헌 Bok et al., 2007, Int. J. Dev. Biol.
    제공 데이터 하단 데이터 참조

    H&E staining

    H&E staining introduce
    분석개요 동결절편과 파라핀절편 샘플을 Hematoxylin과 eosin으로 염색. 내이 유모세포의 조직학적 분석
    측정 파라미터 H&E staining
    장비 -
    분석기간 3일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 실험실
    참고문헌 Song et al., 2011, BBRC
    제공 데이터 하단 데이터 참조

    Hair cell morphology

    Hair cell morphology introduce
    분석개요 내이 조직에서 특정 단백질의 위치를 1차 항체에 형광물질의 부가한 2차 항체를 적용하여 다초점형광현미경
    (confocal microscopy)으로 확인
    측정 파라미터 Immunofluorescence (hair cell morphology)
    장비 Zeiss LSM confocal microscope (Zeiss, Germany)
    분석기간 2일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 이미징 센터
    참고문헌 Song et al., 2011, BBRC
    제공 데이터 하단 데이터 참조

    Electron microscopy

    Electron microscopy introduce
    분석개요 주사(scanning)전자현미경과 투과(transmission)전자현미경을 이용하여 유모세포의 초미세구조를 확인
    측정 파라미터 Electron microscopy (ultra-fine hair cell morphology)
    장비 Hitachi SEM & TEM (Hitachi, Japan)
    분석기간 4일
    구역 연세의료원
    참고문헌 Kwon et al., 2014, HMG
    제공 데이터 하단 데이터 참조

    Immunohistology

    Immunohistology introduce
    분석개요 hair cell 의 생존능과 증식능을 TUNEL assay와 EdU staining을 통하여 확인
    측정 파라미터 TUNEL assay and EdU assay (hair cell survival and proliferation)
    분석기간 2일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 실험실
    참고문헌 Kim et al., 2014, BBRC
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    In situ hybridization

    In situ hybridization introduce
    분석개요 In situ hybridization을 통해 특정유전자의 조직내 발현양상을 확인
    측정 파라미터 In situ hybridization (gene expression pattern)
    분석기간 3일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 실험실
    참고문헌 Son et al., 2015, PNAS
    제공 데이터 예시이미지

    In situ hybridization

    In situ hybridization introduce
    분석개요 조직학적 분석기법(H&E staining)과 중이 표지 유전자(in situhybridization)의 발현을 통해 중이의 구조를 확인
    측정 파라미터 In situ hybridization (gene expression pattern)
    분석기간 3일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) 실험실
    참고문헌 Son et al., 2015, PNAS
    제공 데이터 예시이미지

    Outer ear morphology

    Outer ear morphology introduce
    분석개요 디지털 카메라를 이용하여 외이의 형태를 확인 outer ear (pinna) observation
    측정 파라미터 Outer ear morphology (pinna)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) SPF
    참고문헌 Adhikari et al., 2015, Nat Commun
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    Otoscope

    Otoscope introduce
    분석개요 외이경(Otoscope)을 이용하여 외이도와 고막의 이상 여부를 확인
    측정 파라미터 Otoscope (auditory canal, tympanic membrane)
    장비 XV3 mini endoscopic system (Chammed, Korea)
    분석기간 1일
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) SPF
    참고문헌 Depreux et al., 2008, J Clin Invest.
    제공 데이터 예시이미지
    - Challenged hearing phenotype

    auditory phenotype-Challenged hearing phenotype

    Challenged hearing phenotype

    Challenged hearing phenotype introduce
    분석개요 소음성 난청에 민감도를 보이는 유전자 변형 동물모델 발굴
    측정 파라미터 Noise-induced hearing loss
    장비 Noise induce speaker (SL med 국내제작)
    분석기간 -
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) SPF
    참고문헌 Suzuki et al., 2016, Sci Rep.
    제공 데이터 예시이미지

    Challenged hearing phenotype

    HChallenged hearing phenotype introduce
    분석개요 이독성을 나타내는 화학적 치료 항암약물인 cisplatin 처리 후 청력 역치 분석을 통해 민감한 동물모델 발굴
    측정 파라미터 Drug-induced hearing loss
    장비 SmartEP (Intelligent Hearing Systems, USA)
    분석기간 -
    구역 에비슨의생명연구센터 (ABMRC) SPF
    참고문헌 Hill et al., 2008, Otol Neurotol
    제공 데이터 예시이미지
  • PET-CT Imaging · Metabolism Phenotype

    Metabolism Phenotype

    Metabolism Phenotype

    Metabolism Phenotype introduce
    분석개요 Brown adipose tissue (BAT) 활성도 visceral fat, subcutaneous (SC) fat volume, bone metabolism 정량분석
    측정 파라미터 BAT, visceral fat volume, SC fat volume, bone metabolism
    장비 F-18 FDG, micro PET-CT
    분석기간 4-5일
    구역 분당서울대학교병원 전임상분자영상센터
    제공 데이터 예시이미지
    · Neurology Phenotype

    Neurology phenotype

    Neurology phenotype

    Neurology phenotype introduce
    분석개요 Brain activity, Brain perfusion, Dopamine transporter (DAT) , 기타 정량 분석
    측정 파라미터 Brain activity, Brain perfusion, Dopamine transporter
    장비 micro PET-CT
    분석기간 4-5일
    구역 분당서울대학교병원 전임상분자영상센터
    제공 데이터 예시이미지
    · Cardiology Phenotype

    Cardiology Phenotype

    Cardiology Phenotype

    Cardiology Phenotype introduce
    분석개요 심근의 관류, 대사를 정량적으로 분석
    측정 파라미터 myocardial perfusion, metabolism
    장비 nanoSPECT-CT
    분석기간 3-4일
    구역 분당서울대학교병원 전임상분자영상실
    제공 데이터 예시이미지
  • Clinical and Histopathology · Clinical pathology

    Clinical pathology

    Clinical pathology

    Clinical pathology introduce
    분석개요 혈액을 구성하고 있는 세포의 수나 형태를 정량적으로 측정하고, 혈액의 구성 성분을 정량적으로 분석 측정함
    측정 파라미터 Hematology (적혈구수, 백혈구수, 림프구수, 호중구수 등), Clinical Blood Chemistry (칼륨, 칼슘, 크레아티닌,
    총콜레스테롤 등)
    장비 Hematology automated analyzers
    (Beckman Coulter AcT Diff , Siemens Advia 2120)
    분석기간 1일
    · Histopathology

    Histopathology

    Histopathology

    histopathology introduce
    분석개요 부검(Autopsy)을 통하여 전 장기를 채취하고 병리조직학적으로 병변을 관찰하여 판독함
    측정 파라미터 판독장기 (뇌, 눈, 신경, 뇌척수, 가슴샘, 갑상선, 심장, 기도, 식도, 폐, 간, 쓸개, 위, 소장, 대장, 췌장, 비장, 신장,
    부신, 유선, 림프절, 피부, 근육, 방광, 고환, 부고환, 전립선, 정낭, 난소, 자궁)
    histopathology introduce
    검체 종류
    Live Mouse Only Autopsy
    Autopsy + Only Block 제작
    Autopsy + Block 제작 + Only Sectioning
    Autopsy + Block 제작 + H&E
    Fixed Tissue Only Block 제작
    Block 제작 + Section + H&E
    FFPE Block (Formalin Fixed Paraffin Embedded) Only sectioning
    Sectioning + H&E
    Unstained Slide Only H&E
    FFPE Block (Formalin Fixed Paraffin Embedded) Only sectioning
    Only Block 제작
    Block 제작 + Section + H&E

* 분석을 원하시는 분은 사업단(mouseclinic@snu.ac.kr)으로 연락해 주시기 바랍니다.

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